Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trappc12Q8K2L8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc12Q8K2L8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc12Q8K2L8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc12Q8K2L8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms