Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FntbQ8K2I1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FntbQ8K2I1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FntbQ8K2I1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms