Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrit1Q8K099 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrit1Q8K099 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lrit1Q8K099 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrit1Q8K099 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
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