Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG3

Kdm1b, Lysine-specific histone demethylase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm1bQ8CIG3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm1bQ8CIG3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm1bQ8CIG3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm1bQ8CIG3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms