Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip4Q8CI96 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip4Q8CI96 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip4Q8CI96 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms