Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rftn2Q8CHX7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rftn2Q8CHX7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rftn2Q8CHX7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rftn2Q8CHX7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms