Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nav1Q8CH77 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nav1Q8CH77 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nav1Q8CH77 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nav1Q8CH77 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nav1Q8CH77 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nav1Q8CH77 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nav1Q8CH77 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nav1Q8CH77 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms