Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SltmQ8CH25 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SltmQ8CH25 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SltmQ8CH25 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms