Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp2Q8CGR7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp2Q8CGR7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp2Q8CGR7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms