Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Setd1bQ8CFT2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Setd1bQ8CFT2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setd1bQ8CFT2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Setd1bQ8CFT2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Setd1bQ8CFT2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms