Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup88Q8CEC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup88Q8CEC0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup88Q8CEC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms