Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CDN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CDN1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CDN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CDN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CDN1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDN1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CDN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CDN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CDN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CDN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDN1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDN1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms