Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vcpip1Q8CDG3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vcpip1Q8CDG3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcpip1Q8CDG3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vcpip1Q8CDG3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms