Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
6030452D12RikQ8CD33 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6030452D12RikQ8CD33 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6030452D12RikQ8CD33 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms