Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcas3Q8CCN5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcas3Q8CCN5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcas3Q8CCN5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcas3Q8CCN5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcas3Q8CCN5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bcas3Q8CCN5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcas3Q8CCN5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas3Q8CCN5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms