Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrip1Q8CBD1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrip1Q8CBD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrip1Q8CBD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms