Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc142Q8CAI1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc142Q8CAI1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc142Q8CAI1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc142Q8CAI1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc142Q8CAI1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc142Q8CAI1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc142Q8CAI1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc142Q8CAI1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc142Q8CAI1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc142Q8CAI1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc142Q8CAI1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms