Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa5Q8C7G5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa5Q8C7G5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa5Q8C7G5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa5Q8C7G5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa5Q8C7G5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoa5Q8C7G5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa5Q8C7G5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms