Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5X9

Gm5142, Predicted gene 5142, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5142Q8C5X9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14,43□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,43□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,42□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,41□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm5142Q8C5X9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14,38□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,38□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,37□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,36□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,33□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14,33□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,11
Gm5142Q8C5X9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14,32□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14,32□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14,31□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14,31□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14,31□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14,31□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,31□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Gm5142Q8C5X9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,3 ms