Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClmnQ8C5W0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms