Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccser1Q8C0C4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccser1Q8C0C4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms