Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp5Q8BX09 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp5Q8BX09 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp5Q8BX09 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms