Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV1

Tusc3, Tumor suppressor candidate 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc3Q8BTV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tusc3Q8BTV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tusc3Q8BTV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tusc3Q8BTV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tusc3Q8BTV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms