Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rccd1Q8BTU7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rccd1Q8BTU7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rccd1Q8BTU7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms