Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig4Q8BTF7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lig4Q8BTF7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig4Q8BTF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig4Q8BTF7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig4Q8BTF7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms