Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy4Q8BQ47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy4Q8BQ47 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy4Q8BQ47 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms