Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E130116L18RikQ8BMV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E130116L18RikQ8BMV6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E130116L18RikQ8BMV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E130116L18RikQ8BMV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E130116L18RikQ8BMV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E130116L18RikQ8BMV6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E130116L18RikQ8BMV6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms