Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga3Q8BMI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gga3Q8BMI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga3Q8BMI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga3Q8BMI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga3Q8BMI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms