Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Usp54Q8BL06 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp54Q8BL06 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Usp54Q8BL06 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Usp54Q8BL06 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp54Q8BL06 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms