Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp5Q8BKN5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubgcp5Q8BKN5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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