Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dupd1Q8BK84 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dupd1Q8BK84 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dupd1Q8BK84 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dupd1Q8BK84 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dupd1Q8BK84 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dupd1Q8BK84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dupd1Q8BK84 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dupd1Q8BK84 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dupd1Q8BK84 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dupd1Q8BK84 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms