Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU0

Sgta, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtaQ8BJU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SgtaQ8BJU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgtaQ8BJU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SgtaQ8BJU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgtaQ8BJU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgtaQ8BJU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgtaQ8BJU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms