Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc40Q8BI79 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc40Q8BI79 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc40Q8BI79 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc40Q8BI79 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc40Q8BI79 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc40Q8BI79 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc40Q8BI79 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms