Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pknox2Q8BG99 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pknox2Q8BG99 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms