Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfascQ810U3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfascQ810U3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfascQ810U3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms