Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc172Q810N9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc172Q810N9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc172Q810N9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms