Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Liat1Q810M6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Liat1Q810M6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Liat1Q810M6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Liat1Q810M6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Liat1Q810M6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Liat1Q810M6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Liat1Q810M6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Liat1Q810M6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Liat1Q810M6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Liat1Q810M6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Liat1Q810M6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Liat1Q810M6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms