Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
TnnQ80Z71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TnnQ80Z71 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TnnQ80Z71 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TnnQ80Z71 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TnnQ80Z71 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TnnQ80Z71 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms