Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh8Q80Y20 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alkbh8Q80Y20 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alkbh8Q80Y20 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh8Q80Y20 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms