Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2eQ80UW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2eQ80UW8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2eQ80UW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms