Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab3gap1Q80UJ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab3gap1Q80UJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3gap1Q80UJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms