Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rusc2Q80U22 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rusc2Q80U22 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rusc2Q80U22 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rusc2Q80U22 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rusc2Q80U22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rusc2Q80U22 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rusc2Q80U22 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rusc2Q80U22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Rusc2Q80U22 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Rusc2Q80U22 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rusc2Q80U22 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rusc2Q80U22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rusc2Q80U22 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms