Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC47.82■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC47.67■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC47.66■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC47.66■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC47.63■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC47.55■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.52■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
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