Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC47.95■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
NischQ80TM9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
NischQ80TM9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC47.82■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
NischQ80TM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
NischQ80TM9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
NischQ80TM9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC47.67■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC47.66■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC47.66■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC47.63■■■■■ 5.22
NischQ80TM9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
NischQ80TM9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC47.55■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.52■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
NischQ80TM9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms