Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ube2q1Q7TSS2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2q1Q7TSS2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms