Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EpopQ7TNS8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EpopQ7TNS8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EpopQ7TNS8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms