Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN37

Trpm4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm4Q7TN37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm4Q7TN37 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm4Q7TN37 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm4Q7TN37 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm4Q7TN37 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpm4Q7TN37 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm4Q7TN37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm4Q7TN37 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm4Q7TN37 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm4Q7TN37 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm4Q7TN37 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms