Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HhipQ7TN16 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HhipQ7TN16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HhipQ7TN16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms