Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SyncripQ7TMK9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncripQ7TMK9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncripQ7TMK9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms