Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyfip1Q7TMB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip1Q7TMB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyfip1Q7TMB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyfip1Q7TMB8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms