Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim12Q78RX3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim12Q78RX3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim12Q78RX3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim12Q78RX3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim12Q78RX3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim12Q78RX3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim12Q78RX3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms